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染色体数目和结构异常检测的准确率有多高?

2025-07-09 13:06:02

来源:皇家生殖医院(RFG)

染色体数目和结构异常的检测准确率受检测技术、样本质量、异常类型等因素影响,不同技术的准确率存在差异。目前临床常用的技术包括核型分析、荧光原位杂交(FISH)、基因芯片(array CGH/SNP array)、高通量测序(NGS,如 PGS 中常用的 CNV-seq) 等,其准确率如下:

一、不同技术的准确率对比

检测技术适用场景数目异常准确率结构异常准确率局限性核型分析传统染色体检测(金标准)约 95%(大片段异常)约 90%(≥5Mb 片段)分辨率低(无法检测<5Mb 的微小异常)、耗时(7-10 天)FISH特定染色体靶向检测(如 13、18、21、X、Y)约 90%-95%(靶向染色体)低(仅能检测已知探针覆盖的结构异常)仅能检测预设的 5-10 对染色体,漏检率高基因芯片全基因组拷贝数变异(CNV)检测约 98%-99%(≥100kb)约 95%-98%(≥500kb)无法检测平衡易位、倒位等无拷贝数变化的结构异常NGS(CNV-seq)全基因组高精度检测(主流 PGS 技术)约 99%(≥50kb)约 98%-99%(≥100kb)对平衡易位、低比例嵌合体(<20%)检测敏感性较低

二、关键影响因素

技术分辨率

分辨率越高(如 NGS 可检测 50kb 以上的微小异常),对微小数目异常(如微缺失 / 微重复)的准确率越高。

结构异常中,平衡易位、倒位因无拷贝数变化,基因芯片和 NGS 难以检测,需依赖核型分析(准确率约 90%)或专门的结构变异检测技术(如断裂点测序)。

样本质量

胚胎检测中,样本为极体、卵裂球(第 3 天胚胎)或滋养层细胞(第 5 天囊胚)。若样本细胞数量少、DNA 降解或污染,可能导致假阳性 / 假阴性(如嵌合体胚胎易误判)。

囊胚滋养层细胞样本的准确率(约 95%)高于卵裂球(约 90%),因后者细胞数目少(通常取 1-2 个细胞),嵌合体影响更大。

异常类型

整倍体 / 非整倍体(如 21 三体):NGS 和基因芯片的准确率接近 99%,几乎无漏检。

嵌合体(胚胎中部分细胞正常,部分异常):检测难度高,NGS 对高比例嵌合体(≥30%)的准确率约 90%,但低比例嵌合体(<20%)可能漏检。

复杂结构异常(如多重易位、插入):核型分析准确率约 80%-85%,基因芯片和 NGS 可能因无法识别断裂点而漏检。

三、临床实际准确率

数目异常:主流技术(NGS)对常见非整倍体(如 21 三体、18 三体、性染色体异常)的准确率可达99% 以上,是目前胚胎植入前筛查(PGS)的优选技术。

结构异常

大片段结构异常(如≥5Mb 的缺失 / 重复):基因芯片和 NGS 准确率约 98%。

平衡易位、倒位:核型分析准确率约 90%,但需结合父母核型验证(如父母为平衡易位携带者,胚胎异常类型可预测)。

四、误差来源

假阳性:样本污染(如母源细胞污染)、技术操作误差(如 DNA 扩增偏差)。

假阴性:嵌合体漏检、微小片段异常(<50kb)未被识别、样本细胞未包含异常细胞(如胚胎部分细胞异常,而检测的细胞正常)。

目前NGS(如 CNV-seq) 是染色体异常检测的主流技术,对数目异常(如非整倍体)的准确率可达 99%,对≥100kb 的结构异常准确率约 98%;而平衡易位等复杂结构异常仍需结合核型分析,准确率约 90%。总体而言,在规范操作下,临床检测的综合准确率可达到95% 以上,但无法做到 100%(受技术和生物学特性限制)。检测结果需结合临床病史(如反复流产、胎儿畸形史)和后续产前诊断(如羊水穿刺)进一步验证。

文章发布于 #泰国皇家生殖遗传医院

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